肝细胞癌（HCC）是全球第二大致命癌症。各种原因引起的肝硬化使患者易患HCC，每年使HCC发生率增加2％~4％。肝硬化的发展促进了一系列遗传或表观遗传变化，在增生性结节形成中，HCC处于癌变前期。早期HCC诊断有助于改善预后，并可能进行治疗。由于当前诊断方法的准确性低，迫切需要探索新的非侵入性策略以对肝硬化患者进行早期HCC诊断。
近日，海军军医大学王红阳教授，南方医科大学侯金林教授等共同通讯在《细胞研究》（CellResearch）杂志在线发表题为“Genome-scaleprofilingofcirculatingcell-freeDNAsignaturesforearlydetectionofhepatocellularcarcinomaincirrhoticpatients”的研究论文，该研究基于cfDNA的独特基因组特征，该研究进行了大规模、多中心的研究，并开发了一种新颖的HCC诊断综合方法，强化了HIFI（5-羟甲基胞嘧啶/motIf/片段化/核小体footprInt）方法作为HCC早期诊断和监测的新策略的巨大潜力。
研究详情该研究从中国11个省的13家医院的例肝硬化（LC），例HCC和例健康对照（CTRL）患者中收集了无细胞DNA（cfDNA）样本，并对其进行了随机分配培训，验证和测试队列以开发和评估诊断模型。
该研究采用了最新的下一代测序（NGS）技术来获得cfDNA全基因组的5-羟甲基胞嘧啶（5-hmc），核小体足迹（NF），5末端基序和片段图谱。使用逻辑回归方法，基于这四个功能性模块构建了加权诊断模型。
根据排除标准，最终将例患者（或健康者）纳入研究，并随机分配给培训、验证、测试队列。
在13家医院的例肝硬化（LC）患者中，中位年龄为56岁，男性为76％，诊断为乙肝病毒（HBV）感染的为83.3％，Child-Pugh得分A、B和C分别为80.9％，15.8％和0.2％。
在例HCC患者中，中位年龄为51岁，男性为87.5％，诊断为HBV感染的为79％，64％报告为肝硬化（LC），BCLC肝癌临床分期为0至A期，B至C患者占41.8％和58.2％。
对于例CTRL，中位年龄为54岁，男性为46.4％，无人有慢性肝炎病毒感染、LC或HCC病史。
研究结论基于cfDNA的独特基因组特征，该研究进行了大规模，多中心的研究，并开发了一种新颖的HCC诊断综合方法，强化了HIFI（5-羟甲基胞嘧啶/motIf/片段化/核小体footprInt）方法作为HCC早期诊断和监测的新策略的巨大潜力。
HIFI方法满足了鉴定可用于治疗的早期HCC的迫切需求。总的来说，考虑到其高准确性、无创性和通用性，HIFI方法在高风险人群中具有巨大的公共健康筛查潜力，尤其是在没有HCC成像筛查所需的设备和基础设施的情况下。
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