肝病和肝癌，特别是肝细胞癌（HCC），是一种日益严重的全球性疾病。慢性肝病（CLD）每年导致全球约万人死亡，其中肝癌导致近80万人死亡[1,2]。HCC往往在多年的慢性肝病后形成，以典型的肝硬化为背景。即使是与非酒精性脂肪肝（NAFLD）相关的HCC在没有肝硬化背景的病人中也是一个长期发生的过程，甚至发生于幼年时期。突变在癌症中普遍存在，多年来人们已清楚地认识到体细胞突变与癌症之间的联系。即使突变是存在的，但并不总是足以驱动癌症的发生。相反，我们现在认识到突变的组合是必要的，数量取决于癌症的类型。
在过去的十年中，癌症基因组和相关非癌组织的基因测序彻底改变了我们对癌症如何形成的理解。本文中，作者总结肝脏的测序研究是如何阐明从健康肝脏到HCC的基因进展，以及慢性肝病这个重要的“肝癌滋生地”。肝细胞是HCC的主要起源细胞，但目前认为，胆道上皮细胞与肝细胞之间存在可塑性。中间的细胞群体可能代表肝脏中的一种成熟干细胞，与肝脏疾病的严重程度相关。然而，对于假定的肝干细胞间室内的突变及其在随后的HCC发展中的作用知之甚少。基于这些原因，本文将重点
